Bestuurs-en adviesorganen
1. Directiecomité
De directeur-generaal van het FANC wordt aangesteld door de Koning, op voorstel van de regering. Om het dagelijkse bestuur te verzekeren, wordt hij bijgestaan door departementshoofden (Inrichtingen & Afval, Beveiliging & Vervoer, Gezondheid & Leefmilieu en Support.)
2. Raad van Bestuur
Voorzitter: Jihane Annane
Leden: Thierry Bastin, Marc Boeykens, Philippe Bouko, Emmanuelle Dardenne, Johan De Haes, Toon Dirckx, Joost Germis, Joeri Hens, Martial Pardoen, Frederik Pirard, Mathieu Raedts, Annelies Vandevelde en Sven Vaneycken.
Regeringscommissaris
Ivan Van den Bergh
Auditcomité
Voorzitter: Johan De Haes
Leden: Mathieu Raedts, Philippe Bouko et Sven Vaneycken.
Strategisch comité
Voorzitter: Martial Pardoen
Leden: Thierry Bastin, Marc Boeykens, Toon Dirckx.
3. Wetenschappelijke Raad voor Ioniserende Stralingen
De Wetenschappelijke Raad is een onafhankelijk orgaan, waarin door de minister benoemde leden met een nucleaire expertise zetelen. De Raad levert onder andere adviezen af met betrekking tot vergunningen van grote nucleaire installaties (klasse I).